Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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CCDC142Q17RM4 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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CCDC142Q17RM4 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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CCDC142Q17RM4 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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CCDC142Q17RM4 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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CCDC142Q17RM4 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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CCDC142Q17RM4 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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CCDC142Q17RM4 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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CCDC142Q17RM4 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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CCDC142Q17RM4 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC142Q17RM4 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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