Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 CNPY1-202ENST00000406197 560 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 CXCR4-202ENST00000409817 1895 ntAPPRIS P3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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