Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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ARL2-SNX15V9GYD0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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ARL2-SNX15V9GYD0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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ARL2-SNX15V9GYD0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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ARL2-SNX15V9GYD0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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ARL2-SNX15V9GYD0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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ARL2-SNX15V9GYD0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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ARL2-SNX15V9GYD0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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