Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF3AQ9Y496 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms