Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms