Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DTX4Q9Y2E6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms