Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms