Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BARX2Q9UMQ3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms