Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPCN1Q9ULQ1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms