Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF346Q9UL40 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF346Q9UL40 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF346Q9UL40 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF346Q9UL40 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF346Q9UL40 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF346Q9UL40 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF346Q9UL40 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF346Q9UL40 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF346Q9UL40 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF346Q9UL40 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF346Q9UL40 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF346Q9UL40 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF346Q9UL40 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF346Q9UL40 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF346Q9UL40 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF346Q9UL40 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF346Q9UL40 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF346Q9UL40 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF346Q9UL40 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF346Q9UL40 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF346Q9UL40 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF346Q9UL40 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF346Q9UL40 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms