Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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GTF3C4Q9UKN8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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GTF3C4Q9UKN8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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GTF3C4Q9UKN8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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