Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP8AP2Q9UKL3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP8AP2Q9UKL3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms