Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP3Q9UKI2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms