Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms