Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTNNA3Q9UI47 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA3Q9UI47 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms