Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDAC6Q9UBN7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms