Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL9Q9P2J3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL9Q9P2J3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms