Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL1Q9NSC2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SALL1Q9NSC2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms