Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB6BQ9NRW1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms