Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMCO4Q9NRQ5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMCO4Q9NRQ5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms