Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASS4Q9NQ75 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms