Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms