Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMYD3Q9H7B4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms