Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP62CLQ9H1M0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms