Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTMR12Q9C0I1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTMR12Q9C0I1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms