Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHACTR1Q9C0D0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHACTR1Q9C0D0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHACTR1Q9C0D0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHACTR1Q9C0D0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHACTR1Q9C0D0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHACTR1Q9C0D0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PHACTR1Q9C0D0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHACTR1Q9C0D0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHACTR1Q9C0D0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHACTR1Q9C0D0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHACTR1Q9C0D0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHACTR1Q9C0D0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHACTR1Q9C0D0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHACTR1Q9C0D0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHACTR1Q9C0D0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHACTR1Q9C0D0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHACTR1Q9C0D0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHACTR1Q9C0D0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms