Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT23Q9C075 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT23Q9C075 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms