Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUS3Q9BZE2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms