Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR3CQ9BUI4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3CQ9BUI4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms