Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTA3Q9BTC8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTA3Q9BTC8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms