Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRACR2AQ9BSW2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms