Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP19Q99542 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms