Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIN3AQ96ST3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIN3AQ96ST3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms