Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms