Protein–RNA interactions for Protein: Q96RU3

FNBP1, Formin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNBP1Q96RU3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FNBP1Q96RU3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FNBP1Q96RU3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms