Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNFRSF13CQ96RJ3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms