Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A9Q96Q91 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms