Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGAP1Q96PV0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGAP1Q96PV0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139 ms