Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC7Q96M83 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms