Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX22Q96L94 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX22Q96L94 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms