Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPNS2Q96L46 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPNS2Q96L46 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms