Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLMNQ96JQ2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLMNQ96JQ2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLMNQ96JQ2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLMNQ96JQ2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLMNQ96JQ2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLMNQ96JQ2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLMNQ96JQ2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLMNQ96JQ2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLMNQ96JQ2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLMNQ96JQ2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms