Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPL1Q96JK4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HHIPL1Q96JK4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms