Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG3Q96JB2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms