Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms