Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIRT1Q96EB6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SIRT1Q96EB6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms