Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCC1Q96CN9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms