Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC74AQ96AQ1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC74AQ96AQ1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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