Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms