Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TSR2Q969E8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSR2Q969E8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSR2Q969E8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSR2Q969E8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSR2Q969E8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSR2Q969E8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSR2Q969E8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSR2Q969E8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSR2Q969E8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSR2Q969E8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSR2Q969E8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSR2Q969E8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSR2Q969E8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSR2Q969E8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSR2Q969E8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSR2Q969E8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSR2Q969E8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSR2Q969E8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSR2Q969E8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSR2Q969E8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSR2Q969E8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms